物流运输公司一般纳税人开票税率是11%。
根据《中华人民共和国增值税法》规定,物流运输服务属于应税服务,税率为11%。因此,物流运输公司作为一般纳税人开具发票时,应按照11%的税率计算和缴纳增值税。

但是,根据国家税务总局的政策规定,对于符合一定条件的小微企业,可以享受3%的简易征收税率。如果物流运输公司符合相关条件,可以选择享受简易征收税率。
需要注意的是,税率是按照服务实际发生的地点来确定的。如果物流运输公司的服务跨越多个省市,那么需要根据实际情况来确定税率。同时,如果物流运输公司开具的发票涉及到其他税率,比如货物运输险的税率为6%,则需要分别计算和缴纳不同税率的增值税。
总之,物流运输公司一般纳税人开票税率为11%,但如果符合条件,可以享受3%的简易征收税率。在实际操作中,需要根据服务实际发生的地点和涉及到的其他税率来确定具体的税率。
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